红豆杉是采用种子繁殖和扦插繁殖，以育苗移栽为主。
播种，采种催芽。10月中下旬，果实呈深红色时采收种子。该种子属生理后熟，需要经过1年的湿沙贮藏才能发芽。常采取室外自然变湿沙藏层积法处理种子，以提高发芽率。一般在早春播种。种子贮藏1年后，有30%种子裂口现白时，及时筛出种子，放在0.2%的高锰酸钾溶液中消毒10分钟，再用清水冲洗干净，晾干明水后均匀地播在沟内。条播为主，粒距5～7厘米。也可采用撒播。播种后，挖取松林下带有菌根并过筛的黄壤土覆盖种子，厚度以不见种子为度。幼苗期注意遮荫，播种时覆盖稻草以不见土为适宜，苗期搭建荫棚，透光度在60%。然后铺植苔藓护苗，保护苗床不受日晒雨淋，并经常保持土壤疏松、湿润。种子出苗率在70%以上。
扦插，在树木休眠萌动期，选择砂土、锯末、珍珠岩混合基质作扦插土。选择1-4年生的木质化实生枝，将插条剪为10厘米、15厘米或30厘米长的小段，在剪枝时要求切口平滑、下切口马耳形，2/3以下去叶。选择药剂如ATP、ABT、NAA、IBAA等处理插枝后扦插、盖膜，扦插成活率一般在85%以上。苗期注意保暖，搭建低棚遮荫。翌年移栽。
栽培，地选择疏松、富含腐殖质、呈中性或微酸性的高山台地、沟谷溪流两岸的深厚湿润性棕壤、暗棕壤为好。选圃整地。一般因地制宜在松树林下育苗移栽较好。选择郁闭度在0.6-0.7且无病虫害的湿地松或马尾松成林地作圃地，要求坡度平缓、上层深厚、排水良好。在8-9月份将林内杂草和灌木清除掉，整理成水平梯面，深挖20-30厘米，于11月份浅翻细耙。整地时，施入腐熟基肥。
移栽，一般种子育苗的1-2年，扦插繁殖的1年左右，当苗高长至30-50厘米即可移栽。移栽在10-11月或2-3月萌芽前进行，每穴栽苗1株，浇水，适当遮萌。
红豆杉是一种喜阳性树木，要求生长环境光照充足。但是对于它的幼苗，特别是3年以内的小苗是需要荫蔽环境的，3年之后可以逐渐逐渐见阳光。红豆杉是很怕涝的，所以浇水不易过于频繁，要避免积水，只要能满足它的正常生长需求就行。
红豆杉生长缓慢，及难大面积培育。古人云：“十年树木，百年树人”，普通树木十年长成木材，但是红豆杉百年后可能还只能称之为“小树”。
因此从红豆杉中提炼出来的紫杉醇是非常昂贵的。